融合基因变异分子检测

发布时间:2026-06-16 08:41:48

检测项目

血液系统肿瘤相关融合基因检测:针对白血病、淋巴瘤等,检测如BCR-ABL1、PML-RARA等关键融合基因,用于诊断、分型与疗效监测。

实体瘤相关融合基因检测:在肺癌、肉瘤、甲状腺癌等实体瘤JianCe测如ALK、ROS1、RET、NTRK等驱动基因融合,指导靶向治疗。

罕见及未知融合基因筛查:利用高通量测序技术,在不预设靶点的情况下,全面筛查样本中可能存在的罕见或新型融合变异。

融合基因定量检测:对已知的特定融合基因(如BCR-ABL1)进行精确定量,动态监测治疗后残留病灶水平,评估治疗反应。

用药伴随诊断融合基因检测:作为特定靶向药物的伴随诊断,检测对应的融合基因状态,是患者能否使用该药物的必要依据。

预后评估相关融合基因检测:检测与疾病预后密切相关的融合基因,如急性白血病中的某些融合类型,用于风险分层和治疗策略制定。

克隆演化监测:通过定期检测融合基因的序列或丰度变化,监控肿瘤克隆的演变,揭示耐药机制。

泛癌种融合基因panel检测:采用包含数十至数百个融合相关基因的试剂盒,一次性对多种癌症相关的融合事件进行高效筛查。

DNA层面融合断点检测:在基因组DNA水平上检测染色体易位导致的基因断裂与重接,确认融合的基因组结构基础。

RNA层面融合转录本检测:在RNA水平直接检测由融合基因产生的异常转录本,能更准确地反映具有功能的融合事件。

检测范围

白血病系列融合基因:涵盖AML、ALL、CML等各类白血病中常见的数十种重现性融合基因,如RUNX1-RUNX1T1、CBFB-MYH11等。

淋巴瘤相关融合基因:包括弥漫大B细胞淋巴瘤、滤泡性淋巴瘤、MALT淋巴瘤等相关的MYC、BCL2、BCL6重排及API2-MALT1等。

软组织与骨肉瘤相关融合基因:检测如EWSR1-FLI1(尤文肉瘤)、SS18-SSX(滑膜肉瘤)、FUS-DDIT3(黏液样脂肪肉瘤)等特征性融合。

非小细胞肺癌驱动基因融合:重点覆盖ALK、ROS1、RET、NTRK1/2/3、NRG1、FGFR2/3等已获批靶向药物的驱动基因融合。

甲状腺癌相关融合基因:主要检测RET、NTRK、ALK、BRAF等基因在乳头状癌、髓样癌等亚型中发生的融合变异。

唾液腺及分泌性乳腺癌相关融合:检测ETV6-NTRK3、MYB-NFIB等具有诊断意义的特征性融合基因。

胶质瘤相关融合基因:包括FGFR-TACC、BRAF-KIAA1549等在中枢神经系统肿瘤中常见的致病性融合。

先天性中胚层肾瘤相关融合:检测ETV6-NTRK3这一在该类儿童肿瘤中高发的特征性融合基因。

泛癌种NTRK基因家族融合:跨癌种筛查NTRK1、NTRK2、NTRK3基因与其他伙伴基因发生的融合,适用于拉罗替尼等广谱靶向药用药筛选。

未知伙伴基因的融合事件:通过特定技术(如RNA测序)识别已知基因与未知基因组序列发生的新型融合,扩大可检范围。

检测方法

实时荧光定量PCR (qPCR):基于特异性引物和探针,对已知序列的常见融合基因进行高灵敏、快速的定性或定量检测。

逆转录PCR (RT-PCR):先将RNA逆转录为cDNA,再用PCR扩增特定融合转录本,通过电泳或测序确认,是传统金标准方法之一。

荧光原位杂交 (FISH):利用荧光标记的核酸探针在细胞或组织原位检测染色体断裂与重排,直观可视,是许多融合基因的临床诊断金标准。

下一代测序 (NGS) - DNA测序:通过对基因组DNA进行高通量测序,捕获染色体易位断点处的序列,可同时检测大量已知和未知的DNA层面融合。

下一代测序 (NGS) - RNA测序:对转录组进行测序,直接检测表达出的异常融合转录本,能发现未知伙伴基因的融合,且避免内含子区非表达变异的干扰。

多重连接探针扩增技术 (MLPA):可用于筛查特定基因是否存在外显子水平的缺失或重复,间接提示可能发生的重排事件。

染色体核型分析:经典的细胞遗传学方法,在显微镜下观察染色体的结构和数目异常,可发现导致基因融合的大型易位或重排。

数字PCR (dPCR):将样本分割成数万个微反应单元进行PCR,可实现绝对定量,尤其适用于低丰度融合基因的精准检测和微小残留病监测。

纳米孔测序技术:基于电信号变化的第三代测序技术,能够产生长读长序列,有利于跨越融合断点进行直接测定,准确解析复杂结构变异。

Sanger测序验证:通常作为其他方法(如PCR、NGS)阳性结果的验证手段,通过直接测定扩增产物的序列来最终确认融合断点的精确位置。

检测仪器设备

实时荧光定量PCR仪: 执行qPCR和dPCR实验的核心设备,通过监测荧光信号实时分析扩增过程,实现靶标定量。

Sanger测序仪(毛细管电泳仪): 用于对PCR产物进行一代测序,提供高准确度的序列信息,常用于验证关键结果。

荧光显微镜及成像系统: FISH技术必备设备,用于观察和采集经荧光探针标记后的细胞核内信号模式,判断是否存在基因重排。

下一代测序平台(Illumina系列): 目前主流的NGS设备(如NovaSeq, NextSeq, MiSeq),基于边合成边测序原理,通量高、成本低,广泛用于DNA/RNA测序以发现融合。

下一代测序平台(Ion Torrent系列): 另一类主流NGS设备(如Genexus, S5),基于半导体芯片检测pH变化进行测序,速度快,适合中小通量临床检测。

纳米孔测序仪(Oxford Nanopore): 如MinION, GridION, PromethION设备,提供超长读长测序能力,对解析复杂的基因组重排和融合结构具有独特优势。

数字PCR仪: 包括微滴式数字PCR仪和芯片式数字PCR仪,通过将反应体系分割实现绝对定量,灵敏度极高。

全自动核酸提取工作站: 实现从组织、血液等样本中高通量、标准化地提取高质量DNA和RNA,是保证后续检测质量的关键前处理设备。

生物分析仪/片段分析仪(如Agilent 2100): 用于评估提取的DNA/RNA的质量、浓度以及文库构建后的片段大小分布,是质控环节的重要工具。

-80℃超低温冰箱及冷链管理系统: 用于长期安全保存珍贵的临床样本(组织、核酸)、试剂和文库,确保生物材料的稳定性和检测结果的可靠性。

检测服务流程

沟通检测需求:为精准把握客户需求,我们会仔细审核申请内容,与客户深入交流,精准识别样品类型、明确测试要求,全面收集相关信息,确保无遗漏。

签订协议:根据沟通确定的检测需求及商定的服务细节,为客户定制包含委托书及保密协议的个性化协议。后续检测严格依协议执行。

样品前处理:收到样品后,开展样品预处理、制样及标准溶液制备等前处理工作。凭借先进仪器设备和专业技术人员,科学严谨对待每个细节,保证前处理规范准确。

试验测试:此为检测核心环节。运用规范实验测试方法精确检测每个样品,实验设计与操作均遵循科学标准,保障测试结果准确且可重复。

出具报告:测试结束立即生成详尽检测报告,经严格审核确保结果可靠准确,审核通过后交付客户。

我们秉持严谨踏实的态度,提供高品质、专业化检测服务。服务全程可追溯,严格遵守保密协议,保障客户满意度与信任度。

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