抗生素残留：针对动物源性食品中常见的β-内酰胺类、四环素类、磺胺类等抗生素进行特异性核酸标记与定量检测。
磺胺类药物残留：专门检测磺胺嘧啶、磺胺二甲嘧啶等磺胺类抗菌药在组织及体液中的残留量。
喹诺酮类药物残留：用于定量分析恩诺沙星、环丙沙星等喹诺酮类药物的残留，监控其滥用情况。
氯霉素残留：高灵敏度检测严禁使用的氯霉素及其衍生物，是进出口食品的关键检测项目。
激素类药物残留：对己烯雌酚、盐酸克伦特罗（瘦肉精）等促生长激素进行痕量级分子检测。
抗寄生虫药残留：检测阿维菌素、伊维菌素等大环内酯类抗寄生虫药物的残留水平。
镇静剂类药物残留：针对养殖运输过程中可能非法使用的安定、氯丙嗪等镇静剂成分进行筛查。
硝基呋喃类代谢物：检测其代谢产物AOZ、AMOZ等，此类药物原体在体内迅速代谢，需检测代谢物。
β-受体激动剂残留：精准定量检测莱克多巴胺、沙丁胺醇等“瘦肉精”成分，保障肉类安全。
孔雀石绿残留：检测水产品中违禁使用的孔雀石绿及其代谢物隐色孔雀石绿，属于重要监控项目。
动物肌肉组织：猪、牛、羊、禽类的肌肉是药物残留监测最主要的样本来源之一。
肝脏与肾脏：作为药物代谢和富集的主要器官，是检测药物残留的关键靶组织。
血液与血清：用于实时或近期药物使用情况的监测，反映动物体内的药物浓度。
乳汁及奶制品：监控奶牛等产奶动物用药后，药物向乳汁中的迁移和残留情况。
鸡蛋及蛋制品：检测禽类用药后，药物在卵形成过程中在蛋内的沉积残留。
蜂蜜及蜂产品：监测养蜂业中抗生素的使用，防止药物污染蜂产品。
水产品组织：鱼、虾、蟹等水产动物的可食部分，重点关注水产养殖用药残留。
饲料及饮用水：从源头检测饲料和饮水中添加的药物成分，进行前端控制。
环境样本（水/土壤）：检测养殖场周边环境介质中的药物扩散与污染状况。
尿液样本：常用于养殖场活体动物的快速筛查与批量监测，样本易于获取。
样品前处理与均质化：将待检组织样本切割并充分均质，确保药物成分能有效提取。
固相萃取净化：使用特定填料的SPE柱去除样本中的脂肪、蛋白质等干扰杂质。
核酸提取与纯化：针对需要检测特定耐药基因或核酸标记物的方法，提取高质量核酸。
反转录反应：若检测目标为RNA（如某些病毒标志物），需先将RNA反转录为cDNA。
TaqMan探针法qPCR：采用序列特异性荧光探针进行检测，特异性高，是主流定量方法。
SYBR Green染料法qPCR：使用能结合双链DNA的荧光染料，成本较低，需配合熔解曲线分析确保特异性。
标准曲线定量法：使用已知浓度的标准品制作标准曲线，据此计算未知样本中的目标物含量。
多重荧光定量PCR：在同一反应体系中同时检测多种药物相关的靶基因，提高通量。
内参基因校准：引入内参基因以校正样本间核酸提取效率及扩增效率的差异，提高准确性。
数据分析与报告生成：通过仪器配套软件分析扩增曲线和Ct值，计算浓度并生成最终检测报告。
实时荧光定量PCR仪：核心设备，能够实时监测PCR循环过程中的荧光信号变化，实现精确定量。
高速冷冻离心机
