
程序性死亡配体-1(PD-L1)蛋白表达:通过免疫组化检测肿瘤细胞或免疫细胞上PD-L1的表达水平,是预测免疫检查点抑制剂疗效的关键生物标志物。
人类表皮生长因子受体2(HER2)基因扩增:检测HER2基因的拷贝数增加,对乳腺癌、胃癌等患者的靶向治疗(如曲妥珠单抗)选择至关重要。
表皮生长因子受体(EGFR)基因突变:主要检测EGFR基因外显子19缺失和L858R点突变等,是非小细胞肺癌患者使用EGFR-TKI类靶向药物的首要依据。
间变性淋巴瘤激酶(ALK)基因融合:验证ALK基因是否与其他基因发生重排融合,是筛选适用于ALK抑制剂(如克唑替尼)的肺癌患者的金标准。
肿瘤突变负荷(TMB):评估肿瘤基因组中每兆碱基对中体细胞突变的总数,高TMB可能提示对免疫治疗有更好的应答。
微卫星不稳定性(MSI)/错配修复(MMR)蛋白:检测DNA错配修复功能状态,MSI-H或dMMR是林奇综合征筛查和预测免疫治疗疗效的重要指标。
肉瘤病毒整合点(NTRK)基因融合:验证NTRK1/2/3基因是否发生融合,是跨癌种使用TRK抑制剂(如拉罗替尼)的必需前提。
乳腺癌易感基因(BRCA1/2)突变:检测生殖细胞或体细胞BRCA1/2基因的功能丧失性突变,用于评估卵巢癌、乳腺癌等患者对PARP抑制剂的敏感性。
Ki-67增殖指数:通过免疫组化检测肿瘤细胞中Ki-67核抗原的表达比例,是评估肿瘤细胞增殖活性和预后的常用指标。
ROS1基因融合:验证ROS1基因是否发生重排,是另一类非小细胞肺癌患者使用特定靶向药物(如克唑替尼)的分子基础。
福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织切片:临床病理最常用的样本类型,适用于绝大多数分子病理学检测,具有良好的可及性和保存性。
新鲜冷冻组织:能更好地保存核酸和蛋白质的完整性,适用于对生物大分子质量要求较高的检测项目,如RNA测序。
肿瘤细胞富集区域:在组织切片上通过病理医生圈定肿瘤细胞密度高的区域,确保后续检测针对肿瘤细胞而非间质细胞。
穿刺活检小标本:包括空心针穿刺、细针穿刺等获取的微量组织,是晚期患者无法手术时进行靶点验证的主要样本来源。
手术切除大标本:通过根治性或姑息性手术获取的完整或部分肿瘤组织,样本量充足,可进行多项、重复的靶点验证。
转移灶组织:对原发灶和转移灶分别进行检测,有助于了解肿瘤异质性和进化,指导后续治疗策略。
肿瘤浸润免疫细胞:特别关注肿瘤微环境中淋巴细胞、巨噬细胞等免疫细胞的组成和状态,与免疫治疗疗效相关。
肿瘤相关血管内皮细胞:评估肿瘤血管生成情况,是抗血管生成靶向治疗(如贝伐珠单抗)的潜在生物标志物研究范围。
癌旁“正常”组织:作为对照样本,用于区分体细胞突变与胚系突变,或评估肿瘤特异性改变。
脱落细胞学标本:如胸腹水、支气管刷检液中的肿瘤细胞,可作为无法获取组织标本时的替代检测材料。
免疫组织化学(IHC):利用抗原-抗体特异性反应,通过显色定位组织切片中的特定蛋白质,是蛋白水平靶点验证的基石技术。
荧光原位杂交(FISH):使用荧光标记的核酸探针与靶序列杂交,在细胞核原位检测基因扩增、缺失或重排,是基因结构变异的金标准检测法。
下一代测序(NGS):高通量平行测序技术,可一次性检测数百个基因的突变、插入/缺失、拷贝数变异和融合等多种变异形式。
Sanger测序:一代测序技术,准确性高,常用于对已知特定基因位点(如EGFR、KRAS)的突变进行验证或小规模检测。
实时荧光定量PCR(qPCR):通过监测PCR过程中的荧光信号,对特定DNA或RNA序列进行定量分析,常用于检测已知热点突变或基因表达水平。
数字PCR(dPCR):将样本分割至大量微反应单元进行PCR,可实现绝对定量,尤其适用于低频突变(如液体活检验证)的检测。
显色原位杂交(CISH):原理类似FISH,但使用酶促显色反应,结果可在普通光学显微镜下观察,便于与组织形态学关联。
逆转录PCR(RT-PCR):先将RNA逆转录为cDNA再进行PCR扩增,主要用于检测基因融合(如ALK、ROS1)或基因表达差异。
多重连接探针扩增技术(MLPA):用于检测基因拷贝数变异(如HER2扩增)和甲基化状态,通量适中,成本较低。
微卫星不稳定性检测(PCR+毛细管电泳):通过PCR扩增特定微卫星位点,再经毛细管电泳分析片段长度,判断MSI状态。
全自动免疫组化染色仪:用于自动完成IHC染色过程中的脱蜡、抗原修复、抗体孵育、显色等步骤,保证染色的一致性和可重复性。
荧光显微镜:配备特定激发/发射滤光片组,用于观察和采集FISH、多重荧光IHC等产生的荧光信号图像。
下一代测序仪:如Illumina NovaSeq、MiSeq系列,Life Technologies Ion Torrent系列等,是实现高通量、多基因平行测序的核心设备。
Sanger测序仪(毛细管电泳仪):基于毛细管电泳分离荧光标记的测序片段,用于完成Sanger测序反应后的读取。
实时荧光定量PCR仪:集成温控与荧光检测模块,可实时监测PCR扩增过程中的荧光强度变化,用于qPCR检测。
数字PCR仪:通过微滴生成或芯片分区技术实现样本数字化,如Bio-Rad的微滴式数字PCR系统,用于高灵敏度绝对定量。
病理切片扫描仪(全玻片扫描系统):将整张组织切片高速扫描成高分辨率数字图像,便于远程会诊、图像分析和结果存档。
核酸提取纯化工作站:自动化从FFPE或新鲜组织中提取高质量DNA和RNA,提高样本处理通量和标准化程度。
生物分析仪:如Agilent Bioanalyzer,利用微流控芯片技术快速、精确地评估DNA、RNA或蛋白质的完整性、浓度和片段大小。
激光捕获显微切割系统:在显微镜直视下,通过激光切割并捕获特定细胞群(如纯肿瘤细胞),用于从复杂组织中获取高纯度靶细胞。
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