
α-平滑肌肌动蛋白(α-SMA)表达:检测CAFs最经典的标志物,用于鉴定其活化状态和肌成纤维细胞亚型。
成纤维细胞活化蛋白(FAP)表达:评估CAFs表面特异性酶的表达水平,与肿瘤进展和免疫抑制密切相关。
血小板衍生生长因子受体(PDGFR-α/β):检测CAFs表面关键的生长因子受体,参与其招募和活化信号通路。
胶原蛋白I/III合成与分泌:定量分析CAFs产生细胞外基质主要成分的能力,反映其促纤维化功能。
白细胞介素-6(IL-6)分泌水平:测定CAFs分泌的关键炎性细胞因子,评估其对肿瘤细胞增殖和免疫调节的影响。
转化生长因子-β(TGF-β)信号通路活性:分析CAFs中TGF-β通路关键分子(如Smad2/3磷酸化)的状态,这是其活化的核心途径。
细胞迁移与侵袭辅助能力:通过共培养模型评估CAFs促进肿瘤细胞迁移和侵袭的生物学功能。
血管内皮生长因子(VEGF)表达:检测CAFs促血管生成因子的表达,评价其支持肿瘤血管新生的作用。
代谢重编程分析:考察CAFs的糖酵解、谷氨酰胺代谢等代谢特征,揭示其能量供应角色。
单细胞转录组测序(scRNA-seq):在单细胞水平全面解析CAFs的异质性,鉴定新的亚群及其特异性基因标记。
实体瘤组织样本:适用于肺癌、乳腺癌、结直肠癌、胰腺癌、前列腺癌等多种实体肿瘤的新鲜或石蜡包埋组织。
原代CAFs分离与培养:从手术或活检肿瘤组织中分离、纯化并培养原代CAFs,用于后续功能学研究。
CAFs条件培养基:收集CAFs培养上清,用于分析其分泌组学及对共培养细胞的影响。
肿瘤微环境空间分布:利用多重荧光技术分析CAFs在肿瘤组织不同区域(如侵袭前沿、坏死区)的分布与表型差异。
不同CAFs亚型鉴定:区分炎性CAFs(iCAFs)、肌成纤维细胞样CAFs(myCAFs)、抗原呈递CAFs(apCAFs)等不同功能亚型。
治疗前后动态监测:对比分析化疗、放疗、靶向治疗或免疫治疗前后患者样本中CAFs表型与功能的改变。
转移灶与原发灶对比:比较原发肿瘤和匹配的远处转移灶(如肝转移、骨转移)中CAFs特征的异同。
患者来源的异种移植(PDX)模型:在PDX模型组织中评估人源CAFs的存活、扩增及其对肿瘤生长的支持作用。
癌旁与正常组织对照:将肿瘤组织中的CAFs与配对癌旁组织或正常组织中的成纤维细胞进行对比分析。
血液与体液循环标志物:探索CAFs相关标志物(如FAP、特定胶原片段)在患者外周血或腹腔积液等体液中的水平。
免疫组织化学(IHC)与免疫荧光(IF):在组织切片上原位检测CAFs特异性蛋白的表达与定位,是临床病理的常用方法。
流式细胞术(FCM):对解离的单细胞悬液进行多色标记,快速定量分析CAFs表面标志物及细胞内信号分子。
Western Blot:检测CAFs裂解物中特定目标蛋白的表达水平及翻译后修饰(如磷酸化)。
酶联免疫吸附试验(ELISA):定量检测CAFs条件培养基或患者血清中特定细胞因子、生长因子的分泌浓度。
实时荧光定量PCR(qPCR):测定CAFs中特定基因的mRNA表达水平,用于快速筛选标志物。
RNA测序(RNA-seq):全转录组分析,系统揭示CAFs的基因表达谱、信号通路激活状态及亚型特征。
Transwell共培养实验:通过非接触或接触式共培养体系,评估CAFs对肿瘤细胞迁移、侵袭能力的直接影响。
胶原收缩实验:将CAFs嵌入胶原凝胶中,通过测量凝胶面积收缩率来评估其重塑细胞外基质的能力。
质谱流式(CyTOF)与成像质谱流式(IMC):利用金属标签抗体进行超高参数单细胞蛋白组分析,或在组织原位进行多靶标成像。
活细胞成像与延时摄影:使用共聚焦显微镜等设备,实时观察并记录CAFs与肿瘤细胞之间的动态相互作用。
病理切片扫描仪:用于将IHC/IF染色的组织切片数字化,便于定量分析和远程会诊。
流式细胞分析仪:进行多色流式细胞术分析,必备设备,用于CAFs的表型分选和功能分析。
激光共聚焦显微镜:用于高分辨率、多通道的免疫荧光图像采集和三维重建,分析CAFs的空间结构。
蛋白免疫印迹系统:包括电泳仪、转膜仪和化学发光成像仪,用于Western Blot检测。
酶标仪:读取ELISA等实验的吸光度值,实现分泌蛋白的快速定量。
实时荧光定量PCR仪:进行基因表达水平的精确定量分析。
高通量测序仪:如Illumina系列平台,用于执行RNA-seq、scRNA-seq等测序项目。
细胞培养与活细胞成像系统:提供稳定的培养环境并整合显微镜,用于长时间观察CAFs的动态行为。
质谱流式细胞仪(Helios/CyTOF):实现单细胞水平超过40个参数的蛋白标志物同时检测。
生物分析仪(如Agilent Bioanalyzer):用于评估RNA、DNA样本的质量,是进行高质量测序的前提。
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