表观渗透系数（Papp）：评价药物或化合物在特定模型下跨膜转运速率的核心动力学参数，直接反映其被动扩散能力。
外排比率（ER）：通过比较在有无外排转运蛋白抑制剂存在时的渗透性，评估P-糖蛋白等外排泵对化合物转运的影响程度。
回收率：计算实验结束后在供侧、接收侧及膜上回收的化合物总量占初始量的百分比，用于评估实验系统的可靠性及化合物吸附、降解情况。
单向转运速率：测定化合物从供侧到接收侧（A-to-B）或反向（B-to-A）的单位时间转运量，用于判断是否存在主动转运或外排。
渗透方向性：通过比较A-to-B与B-to-A两个方向的Papp值，定性判断化合物跨膜转运是否存在方向性差异，提示主动转运过程。
时间进程曲线：测定化合物累积渗透量随时间变化的曲线，用于计算稳态渗透速率并判断渗透过程是否线性。
膜完整性参数：通常通过测定荧光黄或甘露醇等标志物的渗透性来验证细胞单层或人工膜的完整性，是数据有效性的前提。
细胞毒性评估：测试化合物在实验浓度下对细胞活力的影响，确保渗透性数据是在非毒性条件下获得，避免假阳性或假阴性结果。
pH依赖性渗透：在不同pH值的缓冲液中测试化合物的渗透性，用于评估其离子化状态对跨膜被动扩散的影响。
温度依赖性：通过比较不同温度（如4℃、37℃）下的渗透系数，帮助区分被动扩散与能量依赖的主动转运过程。
小分子化学药物：包括新化学实体、候选药物及仿制药的渗透性筛选与评估，是口服药物吸收预测的关键步骤。
多肽与蛋白质类药物：评估其通过生物屏障（如肠道黏膜、血脑屏障）的潜在能力，尽管通常渗透性较低。
天然产物及活性成分：从中药或植物提取物中分离的活性单体或组分，评估其生物利用度相关的膜渗透特性。
化妆品功效成分：测试美白、抗衰、防晒等活性成分经皮吸收的渗透动力学，为透皮制剂开发提供依据。
农药及环境化学品：研究其通过皮肤、胃肠道或植物细胞膜的吸收与转运行为，进行毒理学或环境行为评估。
纳米载体与脂质体：评价载药纳米颗粒或脂质体系统本身的跨膜行为及其对包封药物递送效率的影响。
前药分子：对比前药与母体药物的渗透性，验证前药设计在改善膜通透性方面的有效性。
血脑屏障穿透剂：专门针对中枢神经系统药物，评估其穿越体外血脑屏障模型的能力。
肠道吸收促进剂：测试某些辅料或共给药成分对模型药物渗透性的增强效果及机制。
外排转运蛋白底物与抑制剂：鉴定化合物是否为P-gp、BCRP等常见外排泵的底物或抑制剂，研究药物-药物相互作用风险。
Caco-2细胞模型法：利用人结肠癌细胞在Transwell板上培养分化形成极性单层，模拟肠道上皮，是口服药物渗透性评价的“金标准”。
平行人工膜渗透分析（PAMPA）：使用由磷脂和惰性溶剂构成的人工脂质膜进行高通量被动扩散筛选，速度快、成本低。
MDCK细胞模型法：使用狗肾上皮细胞系，生长周期短于Caco-2细胞，常与外排转染子（如MDCK-MDR1）结合用于外排研究。
离体组织扩散池法：使用离体动物或人的皮肤、肠道、角膜等组织，在Franz扩散池等装置中进行渗透实验，更接近生理条件。
磷脂囊泡转运 assay：利用脂质体或磷脂囊泡研究化合物与脂质双分子层的相互作用及跨膜动力学。
表面等离子共振（SPR）技术：通过将生物膜固定在芯片上，实时、无标记地监测化合物与膜的结合及渗透过程。
荧光光谱法：使用环境敏感性荧光探针标记化合物或直接监测其固有荧光，通过荧光强度或偏振变化研究其跨膜行为。
黑脂膜电测量法：在人工形成的黑脂膜两侧施加电压，测量由化合物渗透引起的膜电导变化，用于研究离子通道或载体介导的转运。
计算预测法：基于化合物的理化参数（如LogP, 分子量, 氢键数）利用软件或模型（如QSPR）进行渗透性的理论预测。
微流体器官芯片模型：在微流控芯片上构建包含多种细胞、具有流体剪切力的三维动态屏障模型，用于更仿生的渗透性研究。
Transwell培养板/插入式培养皿：进行细胞模型渗透实验的核心耗材，其聚碳酸酯膜为细胞生长和物质转运提供支撑。
Franz垂直扩散池
UPLC/HPLC系统：高分离度的液相色谱系统，用于准确定量分析接收液及供体液中的化合物浓度，是计算渗透参数的基础。
液相色谱-质谱联用仪（LC-MS/MS）：具备高灵敏度与特异性的分析设备，特别适用于复杂生物基质中低浓度化合物的定量分析。
多功能酶标仪：具备吸光度、荧光和化学发光检测功能，可用于高通量PAMPA实验的终点检测及细胞毒性快速评估。
跨膜电阻测量仪（TEER Meter）：用于无损、实时监测细胞单层的完整性与紧密连接程度，是验证细胞屏障模型质量的关键工具。
恒温振荡培养箱
自动取样器
分析天平（万分之一）
-80℃超低温冰箱与4℃冰箱
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