表观遗传学验证检测涵盖三大核心模块:DNA甲基化分析系统评估染色质DNA的CpG岛甲基化状态;组蛋白翻译后修饰鉴定包括H3K4me3、H3K27ac等活性标记及H3K27me3抑制性修饰的定量分析;染色质三维结构解析通过Hi-C技术捕获染色体空间构象特征。辅助项目包含非编码RNA调控网络验证及染色质可及性ATAC-seq检测。
本检测适用于哺乳动物细胞系(原代/永生化)、冷冻/石蜡包埋组织样本(≥10mg)、外周血单核细胞(PBMC)及特定体液标本(脑脊液/胸腔积液)。研究领域覆盖肿瘤异质性追踪(如ctDNA甲基化溯源)、神经退行性疾病表观记忆机制(Tau蛋白乙酰化关联分析)、胚胎发育表观重编程(ICM细胞多组学整合)及环境暴露表观印记研究(PM2.5暴露的跨代效应)。
DNA甲基化验证采用亚硫酸氢盐转化联合焦磷酸测序(Bisulfite-PCR Pyrosequencing),可实现单碱基分辨率定量(CV<5%)。组蛋白修饰鉴定执行ChIP-exo标准化流程(抗体特异性验证>90%),结合SDS-PAGE/质谱联用进行翻译后修饰位点确证。染色质开放性分析采用Tn5转座酶优化的ATAC-seq方案(测序深度>50M reads),配套使用ENCODE联盟推荐的生物信息学流程。
核心设备包含Illumina NovaSeq 6000测序系统(双S4流动槽配置)、Agilent 4200 TapeStation核酸分析仪(高灵敏度DNA/RNA ScreenTape)及Beckman Coulter CytoFLEX S流式细胞分选平台(6激光配置)。辅助设备涉及Diagenode Bioruptor Pico超声破碎仪(0.1-4ml适配器)、Eppendorf Mastercycler X50梯度PCR仪(Fast Temp模块)和Thermo Orbitrap Fusion Lumos三合一质谱系统(HCD/ETD双碎裂模式)。
沟通检测需求:为精准把握客户需求,我们会仔细审核申请内容,与客户深入交流,精准识别样品类型、明确测试要求,全面收集相关信息,确保无遗漏。
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试验测试:此为检测核心环节。运用规范实验测试方法精确检测每个样品,实验设计与操作均遵循科学标准,保障测试结果准确且可重复。
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