基因组DNA提取与定量：从组织样本中分离纯化总基因组DNA，并通过分光光度法或荧光法进行精确定量，用于后续PCR、测序等分析。
总RNA提取与完整性评估：提取包含mRNA、rRNA、tRNA在内的总RNA，并通过电泳或仪器分析评估其完整性，确保适用于转录组研究。
微量DNA/RNA提取：针对珍贵或微量组织样本进行优化提取，最大化核酸得率，适用于穿刺活检等小样本。
病毒核酸特异性检测：从感染组织中特异性提取并检测病毒DNA或RNA，用于病原体诊断和病毒载量分析。
甲基化DNA分析：提取DNA并进行亚硫酸氢盐处理，用于研究基因启动子区等位点的甲基化状态。
线粒体DNA分离：从细胞总DNA中富集或特异性提取线粒体DNA，用于遗传病、进化及衰老相关研究。
循环肿瘤DNA（ctDNA）检测：从富含正常细胞的肿瘤组织样本中提取并分析释放入血的微量ctDNA，用于肿瘤基因分型。
microRNA提取与鉴定：特异性富集小分子RNA，尤其是microRNA，用于研究其在基因表达调控中的作用。
福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）样本核酸提取：针对FFPE这种特殊处理的存档组织，进行脱蜡和修复后提取核酸，用于回顾性研究。
细菌/真菌核酸提取：从感染或共生组织样本中提取微生物核酸，用于病原体鉴定和微生物组分析。
新鲜冷冻组织：通过液氮速冻并-80°C保存的组织，能最好地保持核酸完整性和生物活性，是高质量核酸的首选来源。
福尔马林固定石蜡包埋组织：临床病理存档最常用的样本类型，核酸存在不同程度降解和交联，需特殊处理。
穿刺活检组织：通过细针或空心针获取的微小组织条，样本量有限，要求提取方法具有高效率和低损耗。
手术切除标本：来自外科手术的较大块组织，需在取样时注意坏死区域和病变区域的区分，确保分析准确性。
组织芯片：将数十至上百个微小组织样本规则排列于同一石蜡块中制成的切片，可用于高通量核酸提取与分析。
动物模型组织：来自实验动物（如小鼠、大鼠）的各类器官或肿瘤组织，用于临床前研究。
植物组织：包括叶片、根、茎、种子等，其细胞壁成分复杂，提取前需进行有效的机械破碎和化学处理。
胚胎及微小组织：发育生物学研究中涉及的早期胚胎或特定微小解剖结构，样本极其微量，操作精度要求高。
古代或特殊保存组织：如考古样本、特殊化学试剂保存的标本，核酸高度降解，提取挑战大。
细胞团或类器官：由细胞培养形成的三维聚集体，模拟组织特性，是新兴的体外研究模型。
酚-氯仿抽提法：经典的有机溶剂提取法，利用酚和氯仿使蛋白质变性并分离，可获得高纯度核酸，但操作繁琐且有毒性。
柱膜法（硅胶膜离心柱）：最常用的商业化方法，核酸在高盐条件下特异性结合硅胶膜，经洗涤后低盐洗脱，快速且重复性好。
磁珠法：利用包被有硅基或功能基团的磁珠，在磁场作用下吸附和分离核酸，易于实现自动化和高通量操作。
盐析法：使用高浓度盐溶液（如醋酸钾、氯化锂）沉淀蛋白质和多糖，随后沉淀核酸，成本低廉，适合大量样本初提。
研磨与匀浆技术：使用液氮研磨、组织匀浆器或珠磨仪对组织进行物理破碎，是释放细胞内核酸的关键第一步。
酶消化法：使用蛋白酶K（尤其对于FFPE样本）或特定裂解酶消化组织中的蛋白质成分，提高核酸释放率和纯度。
加热法：通过高温（如水浴）辅助裂解细胞并灭活核酸酶，常与其他方法联用，简单快速。
固相可逆固定化技术：基于SPRI磁珠的纯化原理，能有效去除引物二聚体、盐离子等杂质，常用于建库前的核酸纯化。
自动化工作站提取：采用液体处理工作站，编程控制磁珠法或柱膜法的全部流程，实现标准化、无人值守的大规模提取。
直接裂解PCR法：使用特殊裂解液快速处理微小组织样本，裂解液可直接用于后续PCR反应，省去纯化步骤，极其快速但灵敏度有限。
组织匀浆仪/研磨仪：通过刀头旋转或研磨珠震动，实现对各种软硬组织的快速、均匀破碎。
冷冻研磨机：在液氮预冷环境下研磨组织，能有效抑制核酸酶活性，防止研磨产热导致的核酸降解。
核酸定量仪（分光光度计）：基于紫外吸收原理（A260/A280）快速测定核酸浓度并评估纯度。
荧光定量仪（Qubit等）：利用荧光染料特异性结合DNA或RNA，进行高灵敏度、高特异性的精确定量，不受常见杂质干扰。
生物分析仪（如Agilent 2100）：基于微流控芯片和荧光检测，可精确分析核酸的浓度、片段大小分布及完整性（如RNA的RIN值）。
高速冷冻离心机：用于样本沉淀、相分离、柱膜法中的过柱离心等步骤，低温功能可维持核酸稳定性。
恒温水浴锅/金属浴：提供精确的孵育温度，用于组织裂解、酶消化、核酸洗脱等温控步骤。
涡旋振荡器：用于快速混匀样本与裂解液、结合液或洗涤液，确保反应充分。
自动化核酸提取仪：集成液体处理、温控、磁分离等功能，可自动完成从样本输入到核酸洗脱输出的全过程。
超微量核酸蛋白测定仪（NanoDrop）：使用微量样本（1-2μL）即可完成核酸浓度和纯度的快速检测，操作简便。
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