早期凋亡细胞比例：检测细胞膜磷脂酰丝氨酸外翻但细胞膜完整的细胞群体，是凋亡的早期标志。
晚期凋亡/坏死细胞比例：检测细胞膜完整性丧失的细胞群体，包括晚期凋亡和继发性坏死细胞。
总凋亡率：早期凋亡与晚期凋亡/坏死细胞比例的总和，反映总的细胞凋亡水平。
活细胞比例：细胞膜完整且未发生磷脂酰丝氨酸外翻的健康细胞群体。
线粒体膜电位变化：通过荧光探针检测线粒体跨膜电位下降，是凋亡早期的关键事件。
Caspase-3/7活性：检测凋亡执行阶段关键蛋白酶Caspase-3和Caspase-7的激活情况。
DNA片段化分析：通过检测亚G1期峰来评估凋亡导致的DNA断裂和含量减少。
Annexin V单阳性细胞：仅Annexin V染色阳性，代表典型的早期凋亡细胞。
PI单阳性细胞：仅碘化丙啶染色阳性，通常代表坏死细胞或晚期凋亡细胞。
Annexin V/PI双阳性细胞：两种染料均染色阳性，代表晚期凋亡或继发性坏死细胞。
悬浮培养细胞：如淋巴细胞、白血病细胞系等，是最常用且易于处理的样本类型。
贴壁培养细胞：需要温和的消化处理使其成为单细胞悬液，且需注意消化对膜蛋白的影响。
动物组织样本：如脾脏、胸腺、肿瘤组织等，需通过机械分离和酶消化制备单细胞悬液。
外周血单个核细胞：从人或动物外周血中分离得到的淋巴细胞、单核细胞等。
骨髓细胞：用于研究血液系统疾病、药物毒性等对造血细胞凋亡的影响。
植物原生质体：适用于植物细胞凋亡及相关信号通路的研究。
酵母细胞：用于研究真菌的程序性细胞死亡机制。
临床活检样本：来自肿瘤或其他病变组织的微量样本，需高效制备单细胞悬液。
药物筛选模型细胞：用于评估化疗药物、靶向药物等对特定细胞凋亡的诱导作用。
干细胞与祖细胞：研究发育、分化过程中或应激条件下的凋亡情况。
Annexin V-FITC/PI双染法：最经典的方法，利用Annexin V结合磷脂酰丝氨酸，PI标记死细胞，通过流式细胞术区分不同状态细胞。
Caspase活性检测法：使用荧光标记的Caspase底物或抗体，通过流式检测细胞内活化的Caspase来指示凋亡。
线粒体膜电位检测法（JC-1法）：JC-1探针在电位正常时形成红色荧光聚集体，电位下降时变为绿色荧光单体，红绿荧光比可反映电位变化。
TUNEL法：末端脱氧核苷酸转移酶介导的dUTP缺口末端标记法，特异性标记凋亡细胞中断裂的DNA 3‘-OH末端。
亚G1峰分析法：用PI染色固定后的细胞，由于凋亡细胞DNA断裂丢失，其DNA含量低于G1期细胞，在流式直方图上形成亚G1峰。
AO/EB双染法：吖啶橙和溴化乙锭染色，在荧光显微镜下区分活细胞、早期凋亡、晚期凋亡和坏死细胞，也可进行流式分析。
Hoechst 33342/PI双染法：Hoechst 33342可穿透活细胞膜对DNA染色，其荧光强度变化及与PI结合情况可用于分析凋亡。
Annexin V-APC/7-AAD法：使用别藻蓝蛋白标记的Annexin V和核酸染料7-AAD进行多色流式分析，适用于多参数检测。
荧光蛋白报告基因法：构建与凋亡标志物（如caspase切割位点）连接的荧光蛋白报告载体，转染细胞后通过荧光变化监测凋亡。
多参数流式细胞术联用：将Annexin V/PI染色与细胞表面标志物、细胞内蛋白染色结合，在特定细胞亚群中分析凋亡。
流式细胞仪：核心设备，用于检测荧光信号并分析细胞群体，需配备488nm（常用）及其他波长激光器。
荧光显微镜：用于观察和初步判断Annexin V/PI等染色的细胞形态与荧光分布。
低速离心机
低速离心机：用于细胞的洗涤、重悬等步骤，通常需要带有控温功能的型号。
生物安全柜或超净工作台：为细胞操作提供无菌环境，防止样本污染。
CO2培养箱：用于培养待检测的活细胞，维持恒定的温度、湿度和CO2浓度。
涡旋振荡器：用于充分混匀细胞悬液或试剂，确保样本均一性。
移液器与无菌吸头：用于精确移取细胞悬液、缓冲液及各种染料试剂。
流式上样管：专用的圆底或尖底试管，适用于流式细胞仪的上样系统。
300目尼龙网筛：用于过滤制备的单细胞悬液，去除细胞团块和杂质，防止堵塞仪器管路。
水浴锅或金属浴
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