隐地素空间转录组分析

发布时间:2025-12-27 16:58:45

检测项目

组织切片制备与固定:对新鲜冷冻或石蜡包埋的组织样本进行超薄切片处理,采用特定固定剂保持RNA完整性与组织形态结构。

透化处理优化:通过化学试剂处理组织切片,使细胞膜通透性增加,确保带有空间条形码的探针能够高效进入细胞内。

空间条形码探针杂交:将含有空间位置信息的寡核苷酸探针与组织切片中的mRNA进行特异性杂交结合。

逆转录与cDNA合成:在组织原位将捕获的mRNA逆转录为带有空间条形码的互补DNA链。

文库构建与扩增:对带有空间信息的cDNA进行建库处理,并通过PCR扩增获得足够测序量的文库产物。

高通量测序分析:使用下一代测序平台对构建的文库进行深度测序,获取数百万个带有空间坐标的基因表达序列。

图像采集与对齐:利用高分辨率荧光显微镜采集组织切片的整体图像,并将测序数据与图像坐标进行精确匹配。

空间基因表达矩阵构建:将测序读数根据空间条形码归类到特定位置区域,生成基因在不同位置的定量表达矩阵。

细胞类型解卷积分析:基于已知细胞类型的标记基因表达谱,推断每个空间点位中不同细胞类型的比例组成。

差异表达区域识别:比较不同解剖区域或病理区域的基因表达模式,识别具有统计学显著差异的空间表达基因。

空间共表达网络分析:研究基因在相邻空间区域的协同表达关系,构建反映功能模块的空间调控网络。

检测范围

肿瘤微环境研究:分析肿瘤组织中癌细胞、免疫细胞及基质细胞的空间分布关系及其相互作用机制。

神经科学研究:应用于大脑皮层、海马体等神经组织的分层结构解析及神经元亚型的空间定位研究。

检测服务流程

沟通检测需求:为精准把握客户需求,我们会仔细审核申请内容,与客户深入交流,精准识别样品类型、明确测试要求,全面收集相关信息,确保无遗漏。

签订协议:根据沟通确定的检测需求及商定的服务细节,为客户定制包含委托书及保密协议的个性化协议。后续检测严格依协议执行。

样品前处理:收到样品后,开展样品预处理、制样及标准溶液制备等前处理工作。凭借先进仪器设备和专业技术人员,科学严谨对待每个细节,保证前处理规范准确。

试验测试:此为检测核心环节。运用规范实验测试方法精确检测每个样品,实验设计与操作均遵循科学标准,保障测试结果准确且可重复。

出具报告:测试结束立即生成详尽检测报告,经严格审核确保结果可靠准确,审核通过后交付客户。

我们秉持严谨踏实的态度,提供高品质、专业化检测服务。服务全程可追溯,严格遵守保密协议,保障客户满意度与信任度。

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