RNA完整性检测:通过电泳或生物分析仪评估RNA样本的完整性,确保无降解或断裂,以保证后续实验如测序或PCR的可靠性,常用RIN值进行量化。
RNA纯度检测:测量RNA样本的A260/A280和A260/A230吸光度比值,判断是否存在蛋白质、酚或盐类污染,标准比值范围确保样本质量适合下游应用。
cDNA合成效率检测:评估逆转录反应中将RNA转化为cDNA的效率和完整性,通过qPCR或荧光检测验证,确保基因表达量测定的准确性。
文库构建质量检测:检查测序文库的浓度、片段大小分布和适配体连接效率,使用荧光计或生物分析仪,确保文库适合高通量测序平台。
测序深度均匀性检测:评估测序数据中 reads 覆盖基因区域的均匀程度,避免覆盖偏差导致表达量计算错误,影响差异表达分析结果。
基因表达定量检测:通过计数 reads 或信号强度计算基因表达水平,使用标准化方法如TPM或FPKM,确保数据可比性和统计可靠性。
差异表达基因检测:统计分析基因在不同条件下的表达变化,识别显著上调和下调的基因,应用于疾病机制或药物响应研究。
批次效应校正检测:评估和校正实验批次间的技术变异,使用统计方法如ComBat,减少非生物因素对表达数据的影响。
数据质量控制检测:检查测序数据的质量指标如Q30百分比和重复率,确保数据可靠性和下游分析的准确性,避免测序错误干扰。
表达验证检测:通过qPCR或其他独立技术验证测序结果的可靠性,确认差异表达基因的真实性,增强研究的可信度。
人类癌症组织样本:用于研究肿瘤基因表达特征,识别生物标志物和治疗靶点,样本需新鲜冷冻或FFPE处理以保持RNA完整性。
植物叶片组织样本:应用于农业研究,分析基因在胁迫响应或发育过程中的表达变化,样本采集需避免RNA降解。
动物模型血液样本:用于毒理学或疾病研究,监测基因表达作为暴露或疾病状态的指标,需抗凝处理防止凝血影响。
细胞培养物样本:包括原代细胞或细胞系,用于药物筛选或功能研究,确保细胞状态一致性和无污染。
微生物菌液样本:应用于环境或工业微生物学研究,分析基因在特定条件下的表达,样本需快速处理防止RNA降解。
临床血清样本:用于无创诊断研究,检测循环RNA或外泌体RNA的表达,样本采集和存储需标准化。
神经系统组织样本:如脑组织,用于神经退行性疾病研究,分析基因表达与病理变化关联,样本需低温保存。
农作物种子样本:应用于育种研究,评估基因在 germination 或 stress 响应中的表达,样本需干燥处理。
海洋生物样本:如鱼类组织,用于生态毒理学研究,监测污染物对基因表达的影响,样本需盐度适应处理。
昆虫样本:用于害虫控制或发育生物学研究,分析基因在生命周期中的表达变化,样本需整体或部分采集。
ISO 20395:2018《生物技术 - 微阵列基因表达分析 - 要求》:规定了微阵列技术进行基因表达分析的质量控制、数据验证和报告要求,确保实验可重复性和数据可靠性。
GB/T 30989-2014《基因芯片表达数据分析方法》:中国国家标准,规范基因芯片数据的预处理、归一化和差异分析流程,适用于科研和临床应用。
MIAME(Minimum Information About a Microarray Experiment)指南:虽非强制标准,但广泛采用于微阵列实验报告,确保数据共享和 reproducibility,涵盖实验设计至数据分析。
EN ISO 22118:2011《食物链分子生物学 - 聚合酶链反应(PCR) - 性能特征》:涉及PCR-based基因表达检测的性能要求,包括特异性、灵敏度和重复性评估。
ASTM E2180-2018《微阵列基因表达数据标准指南》:提供微阵列数据生成和分析的标准化建议,促进数据比较和整合 across studies。
GB/T 37872-2019《高通量测序数据质量控制》:中国标准,规定测序数据的质量评估指标和处理方法,确保基因表达测序结果的准确性。
ISO 20166-1:2018《分子体外诊断检验 - 测序质量控制 - 第1部分:DNA测序》:虽聚焦DNA,但部分内容适用于RNA测序质量控制,涉及错误率和覆盖均匀性。
CLSI MM20-A《微阵列基因表达分析验证》:临床和实验室标准协会指南,提供微阵列实验验证的详细协议,确保临床应用的可靠性。
ISO 17025:2017《检测和校准实验室能力的通用要求》:适用于基因表达检测实验室的质量管理体系,确保人员、设备和程序合规。
GB/T 27401-2008《实验室质量控制规范 分子生物学检测》:中国标准,规范分子生物学实验包括基因表达检测的质量控制措施,减少误差。
高通量测序系统:基于边合成边测序原理,生成数百万 reads 用于基因表达定量,具备高通量和准确性,适用于全转录组分析。
实时荧光定量PCR仪:通过荧光信号监测PCR扩增,定量基因表达水平,具备高灵敏度和特异性,用于验证测序结果或靶向基因检测。
微阵列扫描仪:检测微芯片上的杂交信号,输出基因表达数据,具备高分辨率和线性范围,适用于大规模表达 profiling。
生物分析仪:使用微流体技术评估RNA完整性、纯度和片段大小,提供数字化的质量指标,如RIN值,确保样本质量。
核酸提取仪:自动化完成RNA提取和纯化步骤,减少人为误差和提高 throughput,确保样本一致性和适用于高通量处理。
荧光显微镜成像系统:用于原位杂交或细胞水平表达检测,可视化基因定位和表达水平,具备高灵敏度和多维成像能力。
紫外-可见分光光度计:测量核酸样本的吸光度值,评估浓度和纯度,快速且经济,适用于日常质量检查。
低温离心机:用于样本预处理和RNA分离,保持低温防止降解,具备高速和容量可变性,适用于多种样本类型。
数据存储与处理服务器:高性能计算系统处理大规模测序数据,运行分析软件进行表达定量和统计,确保计算效率和数据安全。
电泳系统:通过凝胶分离核酸片段,评估RNA完整性或文库质量,简单易用,适用于实验室常规检查。
沟通检测需求:为精准把握客户需求,我们会仔细审核申请内容,与客户深入交流,精准识别样品类型、明确测试要求,全面收集相关信息,确保无遗漏。
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样品前处理:收到样品后,开展样品预处理、制样及标准溶液制备等前处理工作。凭借先进仪器设备和专业技术人员,科学严谨对待每个细节,保证前处理规范准确。
试验测试:此为检测核心环节。运用规范实验测试方法精确检测每个样品,实验设计与操作均遵循科学标准,保障测试结果准确且可重复。
出具报告:测试结束立即生成详尽检测报告,经严格审核确保结果可靠准确,审核通过后交付客户。
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