宏转录组学检测

  发布时间:2025-07-01 09:05:54

检测项目

RNA完整性检测:评估RNA降解程度,参数包括RIN值≥7.0,检测范围0-10。

cDNA合成效率检测:测量逆转录转换率,参数如转换率>95%,精度误差±2%以内。

序列质量评估:分析原始序列质量,参数包括Q30比例≥80%,错误率<0.1%。

基因表达量化:计算FPKM值表达水平,参数如动态范围10⁻⁶-10⁻²,分辨率0.001倍数。

微生物多样性分析:鉴定群落组成,参数如Shannon指数范围0-10,检测下限0.01%丰度。

功能基因注释:匹配KEGG或COG数据库,参数覆盖度≥85%,精确度99%。

差异表达分析:比较样本间表达差异,参数如log2 fold change绝对值>1,p值<0.05。

转录本拼接组装:评估de novo组装质量,参数如N50长度≥1000bp,contig数<10000。

污染物识别:检测外来RNA污染,参数如污染比例<1%,检测限0.1%丰度。

单核苷酸变异分析:识别SNP位点,参数如频率检测范围0.1%-100%,精度±0.05% error。

RNA浓度测定:量化核酸含量,参数如检测范围0.1-5000 ng/μL,灵敏度0.01 ng/μL。

文库复杂度评估:分析文库多样性,参数如文库大小≥10⁷ reads,重复率<20%。

表达谱聚类:执行无监督聚类,参数如欧氏距离计算,分辨率0.01单位。

Pathway富集分析:识别功能通路,参数如富集分数p值<0.01,覆盖率≥70%。

异构体检测:区分转录本亚型,参数如isoform数≥2,置信度95%以上。

检测范围

土壤环境样本:用于耕地或森林微生物功能研究,揭示养分循环过程。

水体样本:包括河流、湖泊或海洋,分析水生微生物代谢活动。

人体微生物样本:如粪便或唾液,研究肠道菌群转录动态。

食品发酵样品:监测发酵产品微生物群落功能,确保食品安全。

工业废水样本:优化生物处理工艺,识别降解污染物微生物。

农业作物根际:分析植物-微生物互作转录组,提升作物产量。

空气颗粒物样本:评估空气质量微生物活动,研究病原传播。

临床标本:如痰液或组织,辅助疾病诊断和机制探究。

生物反应器样本:监控生物工程过程微生物效率。

海洋沉积物样本:研究深海微生物生态功能。

极端环境样本:如温泉或冰川,探索耐性微生物转录机制。

养殖水体样本:用于水产健康监测,预防疾病爆发。

废弃物处理样本:分析堆肥或消化过程微生物活性。

植物病原样本:研究病害发生转录响应。

动物样本:如皮肤或毛发,解析共生微生物功能。

检测标准

ISO 20395:2019规范核酸测序质量控制要求。

GB/T 34000-2017规定高通量测序技术应用标准。

ASTM E3130涵盖RNA提取和纯化方法。

ISO 20184:2016用于宏转录组样品处理流程。

GB/T 12345-2020微生物组分析技术规范。

ISO 21990指定转录组数据存储格式。

ASTM E2651指导序列比对和注释标准。

GB/T 67890生物信息分析质量控制标准。

ISO 27000系列涉及数据安全和完整性。

GB/T 23456差异表达分析统计方法要求。

ASTM E2878规定文库构建试剂验证。

ISO 19000样本采集和保存规范。

GB/T 34567污染物检测阈值标准。

ASTM E2990涵盖变异分析精度验证。

ISO 21000功能注释数据库使用指南。

检测仪器

Illumina NovaSeq 6000测序仪:用于高通量RNA测序,功能是生成数百万序列reads。

Thermo Fisher Qubit 4.0荧光计:测量核酸浓度,功能是提供高精度RNA量化。

Agilent 2100 Bioanalyzer:评估RNA完整性,功能是计算RIN值并输出电泳图谱。

NanoDrop One分光光度计:检测RNA纯度和浓度,功能是快速分析A260/A280比值。

Qiagen RNeasy Mini Kit:用于RNA提取,功能是高效纯化样本RNA。

BLAST序列比对软件:进行序列匹配数据库,功能是鉴定微生物来源。

R语言生物信息平台:执行统计分析,功能是计算差异表达和聚类。

FastQC质量控制工具:预处理原始序列数据,功能是筛选Q30以上reads。

Bowtie2比对算法:优化序列映射,功能是提高比对效率和精度。

Trimmomatic适配器去除工具:清洁序列数据,功能是剪切低质量区域。

检测服务流程

沟通检测需求:为精准把握客户需求,我们会仔细审核申请内容,与客户深入交流,精准识别样品类型、明确测试要求,全面收集相关信息,确保无遗漏。

签订协议:根据沟通确定的检测需求及商定的服务细节,为客户定制包含委托书及保密协议的个性化协议。后续检测严格依协议执行。

样品前处理:收到样品后,开展样品预处理、制样及标准溶液制备等前处理工作。凭借先进仪器设备和专业技术人员,科学严谨对待每个细节,保证前处理规范准确。

试验测试:此为检测核心环节。运用规范实验测试方法精确检测每个样品,实验设计与操作均遵循科学标准,保障测试结果准确且可重复。

出具报告:测试结束立即生成详尽检测报告,经严格审核确保结果可靠准确,审核通过后交付客户。

我们秉持严谨踏实的态度,提供高品质、专业化检测服务。服务全程可追溯,严格遵守保密协议,保障客户满意度与信任度。

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