主成分纯度：测定样品中目标化合物的绝对含量或相对含量，是纯度分析最核心的指标。
已知杂质定量：对工艺或降解过程中可能产生的已知结构杂质进行准确定量分析。
未知杂质鉴定：对样品中出现的、结构未知的杂质进行分离和结构解析。
有关物质谱图：获取样品完整的杂质轮廓谱图，用于直观比较不同批次或不同工艺的样品差异。
降解产物分析：通过强制降解试验（如光照、高温、酸碱处理）分析产物，评估药物的稳定性。
残留溶剂检测：测定合成或制备过程中残留的有机溶剂含量，通常需与气相色谱-质谱联用。
无机盐与金属杂质：分析样品中可能含有的催化剂残留、重金属离子等无机杂质。
异构体与对映体纯度：区分和定量分析手性化合物中的不同对映体或非对映体。
聚合物与寡聚体分析：针对高分子或易聚合物质，检测其二聚体、多聚体等聚合相关杂质。
水分含量关联分析：结合质谱数据，分析与水分相关的降解或溶剂化物形成情况。
小分子化学药物：涵盖合成药物、天然产物提取物等分子量通常在1000 Da以下的化合物。
多肽与蛋白质：分析氨基酸序列、翻译后修饰（如磷酸化、糖基化）以及聚合体等。
核酸类药物：包括DNA、RNA、寡核苷酸及其修饰物的纯度和杂质分析。
抗体药物偶联物：复杂生物药，需分析抗体、连接子、小分子毒素及其偶联比例与相关杂质。
脂质与赋形剂：分析脂质体药物中的脂质成分纯度及制剂中辅料的潜在杂质。
中药复杂体系：对中药提取物中多种活性成分及共存成分进行定性与定量分析。
基因治疗载体：如腺相关病毒等病毒载体的衣壳蛋白纯度和空壳率分析。
代谢组学样本：用于生物体内源性小分子代谢物的全谱分析与纯度评估。
化学品与中间体：化工产品、精细化学品及合成中间体的质量控制。
食品与环境污染物：检测食品添加剂、农药残留、环境有害物质等的纯度和种类。
液相色谱-质谱联用：最主流的分析方法，LC实现分离，MS提供定性与定量信息，适用于绝大多数有机化合物。
气相色谱-质谱联用：主要用于挥发性、半挥发性有机物及残留溶剂的分析。
高分辨质谱法：使用飞行时间或轨道阱等高分辨质谱精确测定质量数，用于元素组成推导和未知物鉴定。
串联质谱法：通过多级裂解获取碎片离子信息，用于结构确证和复杂基质中目标物的高选择性检测。
离子淌度质谱法：在质量分析前增加基于形状和尺寸的分离维度，可区分同分异构体并简化复杂谱图。
直接进样质谱法：样品不经色谱分离直接导入质谱，用于快速筛查和高通量纯度初评。
同位素稀释法：使用稳定同位素标记的内标进行绝对定量，是精准定量的金标准方法之一。
多反应监测/选择反应监测: 在串联质谱上设定特定的母离子-子离子对进行扫描，实现极高灵敏度和特异性的定量分析。
<强数据依赖采集与数据非依赖采集: 两种先进的质谱数据采集策略，可在一次分析中同时获取定性和定量信息，尤其适合未知杂质筛查。
<强质谱成像技术: 将质谱分析与空间位置信息结合，用于观察药物、代谢物或杂质在组织切片中的分布纯度情况。
<强三重四极杆质谱仪: 定量分析的黄金标准，具备出色的灵敏度、重现性和线性范围，主要用于目标化合物定量。
<强四极杆-飞行时间串联质谱仪: 结合了QTOF的高分辨率和准确质量数测定能力，适用于未知物鉴定、代谢物筛选及高通量筛查。
<强轨道阱系列高分辨质谱仪: 提供极高的质量分辨率和质量精度，是复杂体系深度表征和蛋白质组学分析的强大工具。
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