淋巴细胞亚群分析：定量检测T细胞（CD3+）、B细胞（CD19+）和NK细胞（CD16+/CD56+）的绝对计数与相对比例，评估机体基础免疫功能。
T细胞亚群分析：进一步区分辅助性T细胞（CD3+CD4+）和细胞毒性T细胞（CD3+CD8+），计算CD4/CD8比值，是免疫失衡的关键指标。
活化T细胞检测：通过检测CD25、HLA-DR、CD38等活化标志物，评估T细胞的激活状态，常用于移植排斥或自身免疫病监测。
记忆T细胞分型：根据CD45RA和CCR7的表达，将T细胞分为初始、中枢记忆、效应记忆和终末效应亚群，反映免疫记忆功能。
调节性T细胞检测：鉴定具有免疫抑制功能的Treg细胞，通常以CD4+CD25+FoxP3+为特征表型，与自身免疫耐受相关。
B细胞发育与分化分析：通过CD10、CD20、CD27、IgD等标志物组合，分析B细胞从幼稚到记忆、浆细胞的不同成熟阶段。
NK细胞功能亚群：根据CD56表达亮度区分CD56bright（免疫调节）和CD56dim（细胞毒性）NK细胞，评估其不同功能倾向。
树突状细胞表型分析：鉴定髓系（CD11c+）和浆细胞样（CD123+）树突状细胞，它们是启动适应性免疫的关键抗原呈递细胞。
白血病淋巴瘤免疫分型：使用大量相关抗体组合，检测异常细胞的系列来源、分化阶段和克隆性，为血液肿瘤诊断与分型提供依据。
细胞内因子检测：在破膜固定后，检测细胞内IFN-γ、IL-2、TNF-α等因子表达，直接评估特定免疫细胞的功能活性。
外周血单个核细胞：最常用的样本来源，通过密度梯度离心获得，包含淋巴细胞、单核细胞等，用于常规免疫状态评估。
骨髓穿刺液：用于血液系统疾病的诊断与分型，特别是白血病、骨髓瘤等，分析造血细胞的发育与异常克隆。
淋巴结/脾脏等淋巴组织：通过组织单细胞悬液制备后进行检测，用于淋巴瘤诊断及组织局部免疫微环境研究。
胸腹水等体腔积液：检测积液中的免疫细胞组成，有助于鉴别感染、肿瘤转移或自身免疫性疾病。
肿瘤组织浸润淋巴细胞：分析肿瘤微环境中TILs的表型和功能，是癌症免疫治疗疗效预测和评估的重要依据。
脐带血：评估新生儿免疫状况及造血干细胞移植的配型与质量监测。
肺泡灌洗液：用于肺部感染、间质性肺病等呼吸系统疾病的局部免疫反应分析。
脑脊液：在中枢神经系统感染、自身免疫性脑炎或多发性硬化等疾病中，分析淋巴细胞浸润情况。
培养的免疫细胞：对体外诱导或基因编辑的免疫细胞（如CAR-T）进行表型鉴定和质量控制。
石蜡包埋组织：通过特殊处理从存档病理切片中提取单细胞进行有限表型分析，用于回顾性研究。
多色流式细胞术：核心方法，使用多种荧光标记的单克隆抗体同时检测多个抗原，实现高通量、多参数的单细胞分析。
样本制备与染色：包括样本采集、抗凝处理、红细胞裂解、抗体孵育及洗涤等一系列标准化前处理步骤。
荧光抗体标记：将针对不同靶抗原的单克隆抗体偶联上特定荧光染料，是多重检测的基础。
设门策略：利用前向散射和侧向散射光信号以及荧光信号，在散点图上逐步圈定目标细胞群进行分析的关键数据分析技术。
胞内染色技术：使用破膜剂处理固定后的细胞，使抗体能够进入细胞内与胞内抗原（如细胞因子、转录因子）结合。
磷酸化流式技术：检测信号通路中关键蛋白的磷酸化状态，动态反映细胞的活化信号网络。
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